Viện Y học Lâm sàng các bệnh nhiệt đới được thành lập theo quyết định số 706/BYT-QĐ ngày 11/11/1989 của Bộ Y tế trên cơ sở xáp nhập 3 bộ phận: Khoa Truyền nhiễm, Khoa Vi sinh (Bệnh viện Bạch Mai) và Bộ môn Truyền nhiễm (Trường Đại học Y Hà Nội). Dựa trên cơ sở Bệnh viện Lây được xây dựng từ nǎm 1911 tại Bạch Mai. 

- Nghiên cứu hệ thống các phương pháp chẩn đoán, điều trị các bệnh truyền nhiễm và các bệnh nhiệt đới.
- Đào tạo và bổ túc cán bộ chuyên khoa Truyền nhiễm ở bậc đại học và sau đại học.
- Hướng dẫn, chỉ đạo chuyên môn kỹ thuật chuyên khoa Truyền nhiễm và Vi sinh lâm sàng cho Y tế cơ sở trong cả nước.
- Hợp tác KHKT trong nước và nước ngoài.
- Phổ biến các kiến thức chuyên ngành Truyền nhiễm cho mọi người, góp phần chǎm sóc sức khỏe ban đầu cho toàn dân.
- Khám và chữa người bệnh thuộc chuyên khoa truyền nhiễm và nhiệt đới tuyến cuối cùng.

Viện trưởng
GS.TSKH Lê Đǎng Hà
Nhà giáo Nhân dân

Phó Viện trưởng:
TS. Cao Vǎn Viên
Thầy thuốc ưu tú

Phó Viện trưởng:
TS. Nguyễn Đức Hiền

Giáo sư: 2
Phó giáo sư: 1
Tiến sỹ: 8
Thạc sỹ: 11
Chuyên khoa cấp 2: 2
Chuyên khoa cấp 1: 12
Bác sỹ, Kỹ sư, Dược sỹ: 7
Cử nhân điều dưỡng: 4
Y tá trung cấp, KTV trung cấp: 53
Hộ lý y công: 18

- Khoa khám bệnh - Thǎm dò chức nǎng: Trưởng khoa: TS. Nguyễn Đức Hiền
- Khoa cấp cứu: Trưởng khoa: Thạc sỹ Nguyễn Hồng Hà
- Khoa viêm gan: Trưởng khoa: TS. Trịnh Thị Ngọc
- Khoa nhiễm trùng tổng hợp: Trưởng khoa: TS. Cao Vǎn Viên
- Khoa KST-HIV/AIDS: Trưởng khoa: TS. Nguyễn Đức Hiền

- Labor vi sinh thường quy.
- Labor vi sinh nghiên cứu

Khối giảng dạy (Bộ môn truyền nhiễm):
Chủ nhiệm bộ môn: GS. TSKH Lê Đǎng Hà

Khối vǎn phòng:

- Phòng Kế hoạch - Tổng hợp
- Phòng Y tá trưởng
- Phòng Tài vụ
- Phòng Hành chính

- Nghiên cứu xây dựng thành công nhiều phác đồ chuẩn về chẩn đoán và điều trị các bệnh truyền nhiễm gay dịch như: Tả, thương hàn đa kháng thuốc, sốt Dengue/SXH Dengue, HIV/AIDS,...
- Hoàn thành nhiều đề tài Nghiên cứu Khoa học cấp Nhà nước, cấp Bộ có giá trị như: Cǎn nguyên virut viêm gan, nhiễm trùng cơ hội trongHIV/AIDS, điều trị thương hàn đa kháng thuốc, bệnh học sốt mò,...
- Đang chủ trì nhiều chương trình quy mô toàn quốc: Giám sát kháng thuốc của Vi khuẩn (ASTS); Điều trị HIV/AIDS, chẩn đoán và điều trị sốt Dengue/SXH Dengue.
- Mở rộng quan hệ quốc tế với WHO, với các nước như Thụy Điển, Nhật Bản, Pháp, Thái Lan,...
- Đào tạo nhiều lớp nội trú, cao học, CKI, CKII, Tiến sỹ và là một trong những cơ sở cho sinh viên, bác sỹ nhiều nước thực tập: Pháp, Mỹ,...